Pri ultrazvočni obdelavi tekočih vzorcev je zelo pomembno izbrati primerno sondo velikosti.
Pri sonikanju tekočih vzorcev je zelo pomembno izbrati ustrezno velikost sonde. Vsaka sonda vključuje priporočen obseg volumna vzorca, ki se lahko prekriva z drugimi sondami. Sonda z velikostjo 5/12 palcev (Φ10) bo na primer zmogla 30-300ml.
Količina vzorca, ki ga je treba obdelati, se mora ujemati s premerom konice. Ena oseba lahko ravna z manj kot 30 ml ali več kot 300 ml tekočine, odvisno od vrste uporabljenega vzorca.
Odvisno od velikosti in oblike se lahko 5/12 palčna sonda težko prilega prostornini 30 ml. Zato je lahko 1/8 palčna (Φ3) mikrotip boljša izbira. Če je prostornina majhna, je potrebna manjša konica za namestitev notranjosti vzorčne cevi. Za vzorce, ki ne presegajo 30 ml, se priporočajo mikroneedli.
Za učinkovito obdelavo vzorcev je potrebna večja sonda zmogljivosti (večja od 300ml). Uporaba ustrezne velikosti sonde bo skrajšala čas obdelave in podaljšala življenjsko dobo sonde.